Facturation électronique des TPE et sociétés : obligations et logiciels

En bref : une société de moins de 250 salariés doit recevoir des factures électroniques depuis le 1er septembre 2026 et les émettre le 1er septembre 2027, avec l’e-reporting de ses ventes aux particuliers et à l’international. Pour une TPE, le bon logiciel est celui qui réunit factures, relances et paiements, et que votre expert-comptable peut lire.

Fonctions dont j'ai besoin

13 logiciels comparés · prix contrôlés le 1 octobre 2026

  1. Indy

    Plateforme agréée Mieux noté

    Idéal pour : Les indépendants qui veulent une facturation et une comptabilité automatisées, sans payer.

    GratuitFormule Essentiel : devis et factures illimités, facturation électronique et comptabilité automatiséeFormules payantes dès 9 € HT / mois

    Promo 1er mois offert sur les formules payantes (appliqué via notre lien)

    Offre gratuite
    Oui, sans limite annoncée
    Essai
    Version gratuite
    Engagement
    Sans engagement en mensuel ; 30 jours satisfait ou remboursé
    • Émission : Inclus : Sans surcoût et sans limite
    • Réception : Inclus : Sans surcoût et sans limite
    • E-reporting : Inclus : Inclus dans toutes les offres
    • Devis : Inclus : Devis, factures d'acompte et d'avoir
    • Relances : Formule supérieure : Relances automatiques dès la formule Plus
    • Comptabilité : Inclus : Comptabilité automatisée ; déclarations Urssaf et TVA en formule Premium
    • Compte pro : Inclus : Compte pro avec carte, facultatif
  2. Dougs Facturation

    Plateforme agréée

    Idéal pour : Les TPE et indépendants qui veulent une plateforme agréée gratuite, e-reporting compris, et un expert-comptable en option.

    GratuitPack facturation électronique à 0 € HT par mois, sans limite de volume ni obligation d'achat
    Offre gratuite
    Oui, sans limite annoncée
    Essai
    Version gratuite
    Engagement
    Sans obligation d'achat
    • Émission : Inclus : Envoi des factures en un clic, sans limite
    • Réception : Inclus : Réception au format Factur-X
    • E-reporting : Inclus : Ventes aux particuliers et à l'international, transmises automatiquement
    • Devis : Inclus : Devis personnalisés
    • Relances : Inclus : Suivi des paiements en temps réel et relances
    • Comptabilité : Formule supérieure : Expert-comptable en ligne dès 79 € HT par mois
  3. Tiime

    Plateforme agréée

    Idéal pour : Les auto-entrepreneurs qui veulent une facturation électronique gratuite et sans limite.

    GratuitOffre gratuite : devis et factures illimités, envoi et réception des factures électroniquesFormules payantes dès 9,99 € HT / mois
    Offre gratuite
    Oui, sans limite annoncée
    Essai
    60 jours (formules payantes)
    Engagement
    Sans engagement
    • Émission : Inclus : Illimitée, format Factur-X
    • Réception : Inclus : Illimitée
    • E-reporting : Inclus : Disponible dans l'offre gratuite
    • Devis : Inclus : Devis et factures illimités ; signature des devis en formule Business
    • Paiement en ligne : Formule supérieure : Liens de paiement en formule Business
    • Relances : Formule supérieure : Relances clients dès la formule Initial
    • Comptabilité : Formule supérieure : Gestion comptable complète en formule Smart
    • Compte pro : Formule supérieure : Compte pro Tiime dès la formule Initial
  4. Abby

    Plateforme agréée

    Idéal pour : Les micro-entrepreneurs qui veulent facturer gratuitement et suivre leur chiffre d'affaires Urssaf au même endroit.

    GratuitFormule Basique : devis et factures illimités, facturation électronique incluseFormules payantes dès 9 € HT / mois

    Promo -40 % sur les formules payantes (Start à 5,40 € HT par mois au lieu de 9 €)

    Offre gratuite
    Oui, sans limite annoncée
    Essai
    14 jours (formules payantes)
    Engagement
    Sans engagement
    • Émission : Inclus : Dès la formule gratuite Basique
    • Réception : Inclus : Abby est plateforme agréée
    • Devis : Inclus : Devis et factures illimités
    • Paiement en ligne : Formule supérieure : Dès la formule Start : 3,4 % + 0,60 € par paiement par carte
    • Relances : Formule supérieure : Relances d'impayés à partir de la formule Pro
    • Comptabilité : Inclus : Livre des recettes et des achats ; comptabilité avancée en formule Pro
    • Compte pro : Non proposé : Compte pro annoncé « bientôt »
  5. Shine

    Plateforme agréée

    Idéal pour : Les indépendants qui veulent leur compte pro et leur facturation dans la même application, gratuitement.

    GratuitOffre Free : compte pro, carte et outil de facturation, devis et factures illimitésFormules payantes dès 9 € HT / mois
    Offre gratuite
    Oui, sans limite annoncée
    Essai
    Version gratuite
    Engagement
    Sans engagement
    • Émission : Inclus : Facturation électronique incluse dans toutes les offres
    • Réception : Inclus : Réception des factures électroniques et paiement en 1 clic
    • Devis : Inclus : Devis et factures illimités
    • Compte pro : Inclus : IBAN français et carte Mastercard dès l'offre Free
  6. Kolecto

    Plateforme agréée

    Idéal pour : Les artisans et créateurs qui veulent centraliser achats, ventes et banque, gratuitement la première année.

    Gratuit avec limitesOffre Créateur : module Essentiel gratuit les 12 premiers mois après la créationFormules payantes dès 12 € HT / mois
    Offre gratuite
    Oui, avec limites
    Essai
    15 jours
    Engagement
    Sans engagement
    • Émission : Inclus : Devis et factures conformes à la réforme
    • Réception : Inclus : Centralisation des factures fournisseurs
    • Devis : Inclus : Devis, signature électronique
    • Paiement en ligne : Formule supérieure : Liens de paiement dans le module Ventes (15 € HT par mois)
    • Relances : Formule supérieure : Relances automatiques dans le module Ventes
    • Comptabilité : Inclus : Pré-comptabilité et exports comptables
    • Compte pro : Non proposé : Connexion de vos comptes existants
  7. VosFactures

    Plateforme agréée

    Idéal pour : Ceux qui facturent peu et veulent le prix le plus bas pour des documents illimités.

    Gratuit avec limitesFormule Micro : 3 documents par mois, facturation électronique incluseFormules payantes dès 5 € HT / mois
    Offre gratuite
    Oui, avec limites
    Essai
    30 jours
    Engagement
    Résiliable à tout moment
    • Émission : Inclus : Dans toutes les formules, sans frais supplémentaires
    • Réception : Inclus : Réception des factures électroniques
    • Devis : Inclus : Devis et acomptes
    • Paiement en ligne : Formule supérieure : Paiement en ligne dès la formule Pro (25 € HT par mois)
    • Relances : Inclus : Suivi et relances dès la formule Micro
    • Comptabilité : Formule supérieure : Registre des dépenses ; pré-comptabilité en formule Pro
    • Compte pro : Non proposé : Synchronisation bancaire en formule Pro
  8. Pennylane

    Plateforme agréée

    Idéal pour : Les créateurs et TPE qui veulent démarrer gratuitement puis passer à une gestion financière complète.

    Gratuit avec limitesPlan Free réservé aux micro-entreprises sans TVA, jusqu'à 1 200 factures par anFormules payantes dès 7 € HT / mois
    Offre gratuite
    Oui, avec limites
    Essai
    15 jours
    Engagement
    Sans engagement
    • Émission : Inclus : Édition des factures conforme, dès le plan Free
    • Réception : Inclus : Réception et centralisation des factures fournisseurs
    • Devis : Inclus : Factures, avoirs et devis
    • Paiement en ligne : Formule supérieure : Lien de paiement (e-virement) dès le plan Starter
    • Relances : Formule supérieure : Scénarios de relance automatisés en plan Essentiel
    • Comptabilité : Formule supérieure : Offres comptables complètes en supplément
    • Compte pro : Formule supérieure : Compte pro Pennylane dès le plan Starter
  9. Henrri

    Solution compatible

    Idéal pour : Ceux qui veulent un logiciel de facturation gratuit, illimité et multi-utilisateur, sans changer d'habitudes.

    GratuitFormule gratuite et illimitée : émission et réception incluses
    Offre gratuite
    Oui, sans limite annoncée
    Essai
    Version gratuite
    Engagement
    Formule gratuite, sans engagement
    • Émission : Inclus : Gratuite, via une plateforme agréée partenaire
    • Réception : Inclus : Gratuite
    • Devis : Inclus : Devis, factures et avoirs illimités
    • Relances : Inclus : Relances clients
    • Compte pro : Non proposé
  10. Qonto

    Plateforme agréée Payant le moins cher

    Idéal pour : Les indépendants et les TPE qui veulent un compte pro solide avec la facturation électronique intégrée.

    dès 9 € HT / moisFormule Basic, facturée 108 € HT par an ; facturation mensuelle possible
    Offre gratuite
    Non
    Essai
    1 mois
    Engagement
    Sans engagement en facturation mensuelle
    • Émission : Inclus : Devis et factures personnalisés, en illimité
    • Réception : Inclus : Centralisation des factures clients et fournisseurs
    • Devis : Inclus : Devis et factures illimités
    • Paiement en ligne : Inclus : Liens de paiement, terminal et Tap to Pay
    • Relances : Formule supérieure : Module Facturation automatisée : 12 € HT par mois en annuel
    • Compte pro : Inclus : IBAN français, 1 carte physique et 2 virtuelles, 30 virements par mois
  11. Freebe

    Solution compatible

    Idéal pour : Les freelances qui veulent un outil tout compris : factures, Urssaf, temps passé et paiement en ligne.

    dès 12,50 € TTC / moisMicro-entreprise, en paiement annuel (150 € TTC par an)
    Offre gratuite
    Non
    Essai
    30 jours, sans carte bancaire
    Engagement
    Sans engagement, résiliable en un clic
    • Émission : Inclus : Via une plateforme agréée partenaire
    • Devis : Inclus : Devis, factures d'acompte, de solde et d'avoir illimités
    • Paiement en ligne : Inclus : Carte et virement via Stripe, sans commission Freebe
    • Comptabilité : Inclus : Livre des recettes et registre des achats automatiques
    • Compte pro : Non proposé : Synchronisation avec plus de 450 banques
  12. Axonaut

    Plateforme agréée

    Idéal pour : Les TPE qui veulent un logiciel de gestion complet : CRM, facturation, compta, stock et compte pro.

    dès 38,80 € HT / moisEngagement 3 ans payé en une fois ; 97 € HT par mois sans engagement
    Offre gratuite
    Non
    Essai
    15 jours
    Engagement
    Au choix : sans engagement, ou 1 à 3 ans payés d'avance
    • Émission : Inclus : Plateforme agréée intégrée
    • Réception : Inclus : Plateforme agréée intégrée
    • Devis : Inclus : Devis et factures illimités
    • Paiement en ligne : Inclus : Paiement en ligne
    • Relances : Inclus : Relances automatiques
    • Comptabilité : Inclus : Comptabilité incluse
    • Compte pro : Inclus : Compte pro Axonaut inclus
  13. Sellsy

    Plateforme agréée

    Idéal pour : Les TPE et PME qui veulent piloter ventes et facturation avec plusieurs utilisateurs.

    dès 39 € HT / moisLicence Facturation, offre Standard, par utilisateur ; engagement 12 mois
    Offre gratuite
    Non
    Essai
    Essai gratuit (durée non précisée)
    Engagement
    12 mois
    • Émission : Inclus : Conforme à la facturation électronique
    • Réception : Inclus : Plateforme agréée du groupe TeamSystem
    • Devis : Inclus : Devis transformés en factures en un clic, signature électronique
    • Paiement en ligne : Inclus : Paiement en ligne sécurisé
    • Relances : Inclus : Relance automatique
    • Comptabilité : Inclus : Pré-comptabilité, rapprochement bancaire (1 banque)
    • Compte pro : Non proposé

Ordre d'affichage : les logiciels gratuits d'abord, puis les autres selon le prix mensuel de leur première formule payante, promotions exclues. Chaque note sur 10 suit la même grille pour tous. Ce comparatif ne couvre pas tout le marché. Quand un éditeur nous rémunère via un lien partenaire, cela ne change ni sa place ni sa note. Voir la méthodologie

Les points d’attention pour une société

  • Plusieurs utilisateurs : vérifiez le prix par utilisateur (Sellsy facture par licence) et les droits d’accès.
  • Le lien avec l’expert-comptable : Pennylane, Tiime ou Qonto proposent des accès dédiés ou des intégrations.
  • Les achats : la réception électronique est l’occasion d’automatiser la saisie et le paiement des factures fournisseurs.
  • La TVA sur les débits : si vous avez opté pour ce régime, l’option doit figurer sur vos factures (nouvelle mention obligatoire).

Faut-il changer de logiciel ?

Pas forcément. Si votre logiciel actuel est une solution compatible, il suffit qu’il soit relié à une plateforme agréée. Demandez-le à votre éditeur et vérifiez le nom de la plateforme sur la liste officielle. Sinon, comparez ci-dessus les solutions qui sont elles-mêmes plateformes agréées.

Questions fréquentes

Ma SASU est-elle une PME ou une ETI pour la réforme ?

Une SASU de moins de 250 salariés est une PME (ou une microentreprise si elle a moins de 10 salariés et 2 millions d’euros de chiffre d’affaires ou de bilan au plus). Son obligation d’émission commence le 1er septembre 2027. La taille s’apprécie au 1er janvier 2025, sur le dernier exercice clos.

Une holding est-elle concernée ?

Une holding animatrice, qui facture des prestations à ses filiales, est assujettie à la TVA : elle est concernée comme toute entreprise. Une holding passive, qui se limite à détenir des participations, ne l’est pas.